نماز شب امام رضا(عيون اخبار الرضاعة : ج ۲ ص ۱۸۱ مشكاة الانوار: ص ۱۱۵ بحار الانوار: ج ۴۹ ص ۹۱، ۱۳۰، ج ۸۲ ص ۳۲، ۸۸، ۲۰۸، ج ۸۴ ص ۸۹، ۲۳۱، ج ۸۶ ص ۵۹)
برنامه نماز شب حضرت در این سفر چنین بود آن حضرت در ثلث آخر شب با تسبیح و تحمید و تکبیر و تهلیل و استغفار از رختخواب بر می خاست و مسواک می زد. سپس وضو میگرفت و به نماز شب می ایستاد.
آن حضرت یازده رکعت نماز شب را چنین میخواند: هشت رکعت آن را به این صورت میخواند که در هر دو رکعت سلام میداد، و در دو رکعت اول یک بار حمد و سه بار توحید میخواند سپس نماز جعفر را در چهار رکعت می خواند که در هر دو رکعت سلام میداد و در رکعت دوم هر نماز بعد از تسبیح و قبل از رکوع قنوت میگرفت و این نماز جعفر را جزء نماز شب به حساب می آورد.
آنگاه دو رکعت دیگر میخواند که در رکعت اول سوره های حمد و ملک» و در رکعت دوم سوره های حمد و انسان را میخواند. سپس حضرت دو رکعت نماز شفع میخواند که در هر رکعت یک حمد و سه توحید می خواند و در رکعت دوم پس از سوره و قبل از رکوع قنوت میگرفت.
سپس یک رکعت نماز وتر را میخواند و در آن یک بار سوره حمد و سه بار سوره توحید و یک بار سوره فلق و یک بار سوره ناس را می خواند و بعد از سوره و قبل از رکوع قنوت می گرفت و می فرمود:
اللَّهُمَّ صَلِّ عَلَى مُحَمَّدٍ وَ آلِ مُحَمَّدٍ اللَّهُمَّ اهْدِنَا فِيمَنْ هَدَيْتَ وَ عَافِنَا فِيمَنْ عَافَيْتَ وَ تَوَلَّنا فيمَنْ تَوَلَّيْتَ وَبَارِكْ لَنَا فِيمَا أَعْطَيْتَ وَ قِنَا شَرَّ مَا قَضَيْتَ فَإِنَّكَ تَقْضَى وَ لا يُقْصَى عَلَيْكَ إِنَّهُ لا يَذِلُّ مَنْ وَالَيْتَ وَ لَا يَعُزُّ مَنْ عَادَيْتَ تبَارَكْتَ رَبَّنَا وَ تَعَالَيْتَ
پروردگارا بر محمد و آل محمد صلوات فرست. خداوندا ما را در زمره هدایت شدگان و عافیت داده شدگان قرار ده و امور ما را تو در دست گیر در آنچه به ما داده ای برکت ده و ما را از مقدرات شر دور بدار به راستی که تو مقدر میکنی ولی برای تو مقدر نمی شود. هر کس که تو دوست بداری ذلیل نمیگردد و هر کس که تو دشمنش باشی عزیز نمی شود. خداوندا تو مبارک و بلند مرتبه ای سپس حضرت هفتاد مرتبه می فرمود: «اَسْتَغْفِرُ اللَّهَ وَ أَسْأَلُهُ التَّوْبَةَ»: «استغفار میکنم و از خداوند توبه میطلبم آنگاه سلام نماز را می داد و تعقیبات را شروع می کرد.