نمازهای واجب امام رضا(بحار الانوار: ج ۴۹ ص ۹۱، ۱۳۰، ج ۸۲ ص ۳۲، ۸۸، ۲۰۸، ج ۸۴ ص ۸۹، ۲۳۱، ج ۸۶ ص ۵۹، عیون اخبار الرضاء : ج ۲ ص ۱۸۱ مشكاة الانوار: ص ۱۱۵)
برنامه کلی نمازهای امام رضا در این سفر چنین بود: حضرت در تمام نمازهای واجب خود در رکعت اول سوره های حمد و قدر» و در رکعت دوم سوره های حمد و توحید را میخواند؛ مگر در نمازهای صبح و ظهر و عصر روز جمعه که در رکعت اول آنها سوره های حمد و جمعه» و در رکعت دوم سوره های حمد و منافقین را می خواند.
آن حضرت در نماز عشای شب جمعه در رکعت اول سوره های حمد و جمعه و در رکعت دوم سوره های حمد و اعلی را می خواند.
در نماز صبح روز دوشنبه و پنجشنبه در رکعت اول سوره های حمد و انسان و در رکعت دوم سوره های حمد و غاشیه را می خواند.
حضرت نمازهای مغرب و عشا و شب و شفع و و تر و صبح را با صدای بلند و نمازهای ظهر و عصر را آهسته قرائت می نمود.
آن حضرت در رکعت سوم و چهارم نمازهای چهار رکعتی سه بار می فرمود: سبحان الله و الحمد لله و لا اله الا الله والله اكبر» و ذكر قنوت نمازهای واجب حضرت این بود:
رَبِّ اغْفِرْ وَارْحَمْ وَ تَجاوَزُ عَمَّا تَعْلَمُ إِنَّكَ أَنْتَ الْآعَزُ الْأَجَلُ الْأَكْرَمُ. پروردگارا، ببخش و رحم کن و از آنچه میدانی گذشت کن که تو عزیز و جلیل و کریم هستی.
امام رضایی در تمام نمازهای شب و روز بسم الله الرحمن الرحيم را با صدای بلند می فرمود در طول سفر به خراسان حضرت نمازهای واجب را دو رکعت میخواند مگر نماز مغرب که سه رکعت بود و نافله آن هیچگاه ترک نمی شد. همچنین نماز شب و شفع و وتر و نافله صبح هرگز ترک نشد.
آن حضرت در راه نافله های نماز ظهر و عصر را نمی خواند و بعد از سلام نمازهای ظهر و عصر شکسته سه بار می فرمود: «سبحان الله و الحمد لله ولا اله الا الله والله اکبر و میفرمود این ذکر به جای آن دو رکعتی است که خوانده نمی شود.
امام رضا دعاهای خود را با ذکر صلوات شروع می کرد و این ذکر را در نماز و در غیر نماز بسیار میگفت.